今天就跟大家聊聊有关使用python如何实现一个em算法，可能很多人都不太了解，为了让大家更加了解，小编给大家总结了以下内容，希望大家根据这篇文章可以有所收获。
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数据集：伪造数据集（两个高斯分布混合）
数据集长度：1000
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运行结果：
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the Parameters set is:
alpha0:0.3, mu0:0.7, sigmod0:-2.0, alpha1:0.5, mu1:0.5, sigmod1:1.0
----------------------------
the Parameters predict is:
alpha0:0.4, mu0:0.6, sigmod0:-1.7, alpha1:0.7, mu1:0.7, sigmod1:0.9
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import numpy as np
import random
import math
import time
def loadData(mu0, sigma0, mu1, sigma1, alpha0, alpha1):
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初始化数据集
这里通过服从高斯分布的随机函数来伪造数据集
:param mu0: 高斯0的均值
:param sigma0: 高斯0的方差
:param mu1: 高斯1的均值
:param sigma1: 高斯1的方差
:param alpha0: 高斯0的系数
:param alpha1: 高斯1的系数
:return: 混合了两个高斯分布的数据
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# 定义数据集长度为1000
length = 1000
# 初始化第一个高斯分布，生成数据，数据长度为length * alpha系数，以此来
# 满足alpha的作用
data0 = np.random.normal(mu0, sigma0, int(length * alpha0))
# 第二个高斯分布的数据
data1 = np.random.normal(mu1, sigma1, int(length * alpha1))
# 初始化总数据集
# 两个高斯分布的数据混合后会放在该数据集中返回
dataSet = []
# 将第一个数据集的内容添加进去
dataSet.extend(data0)
# 添加第二个数据集的数据
dataSet.extend(data1)
# 对总的数据集进行打乱（其实不打乱也没事，只不过打乱一下直观上让人感觉已经混合了
# 读者可以将下面这句话屏蔽以后看看效果是否有差别）
random.shuffle(dataSet)
#返回伪造好的数据集
return dataSet
def calcGauss(dataSetArr, mu, sigmod):
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根据高斯密度函数计算值
依据：“9.3.1 高斯混合模型” 式9.25
注：在公式中y是一个实数，但是在EM算法中(见算法9.2的E步)，需要对每个j
都求一次yjk，在本实例中有1000个可观测数据，因此需要计算1000次。考虑到
在E步时进行1000次高斯计算，程序上比较不简洁，因此这里的y是向量，在numpy
的exp中如果exp内部值为向量，则对向量中每个值进行exp，输出仍是向量的形式。
所以使用向量的形式1次计算即可将所有计算结果得出，程序上较为简洁
:param dataSetArr: 可观测数据集
:param mu: 均值
:param sigmod: 方差
:return: 整个可观测数据集的高斯分布密度（向量形式）
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# 计算过程就是依据式9.25写的，没有别的花样
result = (1 / (math.sqrt(2*math.pi)*sigmod**2)) * np.exp(-1 * (dataSetArr-mu) * (dataSetArr-mu) / (2*sigmod**2))
# 返回结果
return result
def E_step(dataSetArr, alpha0, mu0, sigmod0, alpha1, mu1, sigmod1):
'''
EM算法中的E步
依据当前模型参数，计算分模型k对观数据y的响应度
:param dataSetArr: 可观测数据y
:param alpha0: 高斯模型0的系数
:param mu0: 高斯模型0的均值
:param sigmod0: 高斯模型0的方差
:param alpha1: 高斯模型1的系数
:param mu1: 高斯模型1的均值
:param sigmod1: 高斯模型1的方差
:return: 两个模型各自的响应度
'''
# 计算y0的响应度
# 先计算模型0的响应度的分子
gamma0 = alpha0 * calcGauss(dataSetArr, mu0, sigmod0)
# 模型1响应度的分子
gamma1 = alpha1 * calcGauss(dataSetArr, mu1, sigmod1)
# 两者相加为E步中的分布
sum = gamma0 + gamma1
# 各自相除，得到两个模型的响应度
gamma0 = gamma0 / sum
gamma1 = gamma1 / sum
# 返回两个模型响应度
return gamma0, gamma1
def M_step(muo, mu1, gamma0, gamma1, dataSetArr):
# 依据算法9.2计算各个值
# 这里没什么花样，对照书本公式看看这里就好了
mu0_new = np.dot(gamma0, dataSetArr) / np.sum(gamma0)
mu1_new = np.dot(gamma1, dataSetArr) / np.sum(gamma1)
sigmod0_new = math.sqrt(np.dot(gamma0, (dataSetArr - muo)**2) / np.sum(gamma0))
sigmod1_new = math.sqrt(np.dot(gamma1, (dataSetArr - mu1)**2) / np.sum(gamma1))
alpha0_new = np.sum(gamma0) / len(gamma0)
alpha1_new = np.sum(gamma1) / len(gamma1)
# 将更新的值返回
return mu0_new, mu1_new, sigmod0_new, sigmod1_new, alpha0_new, alpha1_new
def EM_Train(dataSetList, iter=500):
'''
根据EM算法进行参数估计
算法依据“9.3.2 高斯混合模型参数估计的EM算法” 算法9.2
:param dataSetList:数据集（可观测数据）
:param iter: 迭代次数
:return: 估计的参数
'''
# 将可观测数据y转换为数组形式，主要是为了方便后续运算
dataSetArr = np.array(dataSetList)
# 步骤1：对参数取初值，开始迭代
alpha0 = 0.5
mu0 = 0
sigmod0 = 1
alpha1 = 0.5
mu1 = 1
sigmod1 = 1
# 开始迭代
step = 0
while (step < iter):
# 每次进入一次迭代后迭代次数加1
step += 1
# 步骤2：E步：依据当前模型参数，计算分模型k对观测数据y的响应度
gamma0, gamma1 = E_step(dataSetArr, alpha0, mu0, sigmod0, alpha1, mu1, sigmod1)
# 步骤3：M步
mu0, mu1, sigmod0, sigmod1, alpha0, alpha1 = M_step(mu0, mu1, gamma0, gamma1, dataSetArr)
# 迭代结束后将更新后的各参数返回
return alpha0, mu0, sigmod0, alpha1, mu1, sigmod1
if __name__ == '__main__':
start = time.time()
# 设置两个高斯模型进行混合，这里是初始化两个模型各自的参数
# 见“9.3 EM算法在高斯混合模型学习中的应用”
# alpha是“9.3.1 高斯混合模型” 定义9.2中的系数α
# mu0是均值μ
# sigmod是方差σ
# 在设置上两个alpha的和必须为1，其他没有什么具体要求，符合高斯定义就可以
alpha0 = 0.3 # 系数α
mu0 = -2 # 均值μ
sigmod0 = 0.5 # 方差σ
alpha1 = 0.7 # 系数α
mu1 = 0.5 # 均值μ
sigmod1 = 1 # 方差σ
# 初始化数据集
dataSetList = loadData(mu0, sigmod0, mu1, sigmod1, alpha0, alpha1)
#打印设置的参数
print('---------------------------')
print('the Parameters set is:')
print('alpha0:%.1f, mu0:%.1f, sigmod0:%.1f, alpha1:%.1f, mu1:%.1f, sigmod1:%.1f' % (
alpha0, alpha1, mu0, mu1, sigmod0, sigmod1
))
# 开始EM算法，进行参数估计
alpha0, mu0, sigmod0, alpha1, mu1, sigmod1 = EM_Train(dataSetList)
# 打印参数预测结果
print('----------------------------')
print('the Parameters predict is:')
print('alpha0:%.1f, mu0:%.1f, sigmod0:%.1f, alpha1:%.1f, mu1:%.1f, sigmod1:%.1f' % (
alpha0, alpha1, mu0, mu1, sigmod0, sigmod1
))
# 打印时间
print('----------------------------')
print('time span:', time.time() - start) 
