1、调用的路径，相对路径有时候不是很靠谱。
2、被调用的脚本有没有执行权限。
3、被调用的脚本能不能及时return，因为默认情况下php的页面只有30sec的执行周期。
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1.使用system函数调用最好在前面指定shell路径，如：
system("/bin/bash ./start-instance.sh",$status);
2.
exec("/**/**.sh > /dev/null 2>&1 &");
把shell扔给后台，而且把输出重定向到空设备。
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在PHP中调用外部命令，可以用如下三种方法来实现：
1） 用PHP提供的专门函数
PHP提供共了3个专门的执行外部命令的函数：system()，exec()，passthru()。
system()
原型：string system (string command [, int return_var])
system()函数很其它语言中的差不多，它执行给定的命令，输出和返回结果。第二个参数是可选的，用来得到命令执行后的状态码。
例子：
system("/usr/local/bin/webalizer/webalizer");
?>
exec()
原型：string exec (string command [, string array [, int return_var]])
exec() 函数与system()类似，也执行给定的命令，但不输出结果，而是返回结果的最后一行。虽然它只返回命令结果的最后一行，但用第二个参数array可以 得到完整的结果，方法是把结果逐行追加到array的结尾处。所以如果array不是空的，在调用之前最好用unset()最它清掉。只有指定了第二个参 数时，才可以用第三个参数，用来取得命令执行的状态码。
例子：
exec("/bin/ls -l");
exec("/bin/ls -l", $res);
#$res是一个数据，每个元素代表结果的一行
exec("/bin/ls -l", $res, $rc);
#$rc的值是命令/bin/ls -l的状态码。成功的情况下通常是0
?>
passthru()
原型：void passthru (string command [, int return_var])
passthru() 只调用命令，不返回任何结果，但把命令的运行结果原样地直接输出到标准输出设备上。所以passthru()函数经常用来调用象pbmplus（Unix 下的一个处理图片的工具，输出二进制的原始图片的流）这样的程序。同样它也可以得到命令执行的状态码。
例子：
header("Content-type: p_w_picpath/gif");
passthru("./ppmtogif hunte.ppm");
?>
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后来，把shell脚本放到了safe_mode_exec_dir目录，调用成功~~
写个页面的东西，来执行服务器上命令，最简单的比如reboot命令，用php来调用 参考网上方法如下
先建立一个脚本（ /root/reboot_server.sh ），重启用的。
代码如下:
#!/bin/bash
reboot
再给他赋予权限 4755
chown root:root /root/reboot_server.sh
chmod 4755 /root/reboot_server.sh
chmod 4777 /sbin/reboot
、
再在 php 里, 想办法做如下调用 php
reboot.php 代码如下:
exec ("/root/reboot_server.sh",$out,$status);
print_r($out);
print_r($status);
?>
然后，通过页面来访问reboot.php(lnmp平台做了虚拟主机，可以通过域名来访问x.x.com/reboot.php)
其结果返回 126的状态码，搜索网上解决方案，一直无果
索性将/root/reboot_server.sh移到了和reboot.php 同一个目录中
访问，可以了，返回状态码0 系统重启了
意识到是目录权限的问题，/root目录对php的用户www没有可执行权限
chmod -R 755 /root
然后把reboot_server.sh移动到了/root 重新测试
搞定了
