circ2Traits数据库有什么用-成都创新互联网站建设

关于创新互联

多方位宣传企业产品与服务 突出企业形象

公司简介 公司的服务 荣誉资质 新闻动态 联系我们

circ2Traits数据库有什么用

这篇文章主要为大家展示了“circ2Traits数据库有什么用”,内容简而易懂,条理清晰,希望能够帮助大家解决疑惑,下面让小编带领大家一起研究并学习一下“circ2Traits数据库有什么用”这篇文章吧。

创新互联网站建设公司一直秉承“诚信做人,踏实做事”的原则,不欺瞒客户,是我们最起码的底线! 以服务为基础,以质量求生存,以技术求发展,成交一个客户多一个朋友!专注中小微企业官网定制,网站制作、成都网站设计,塑造企业网络形象打造互联网企业效应。

miRNA的研究起步很早,miRNA与疾病相关的文献和数据库也相对成熟,而circRNA作为最近兴起的一种RNA, 可以作为miRNA  sponger与miRNA结合, 发挥转录后调控功能。

circ2Traits是一个环状RNA相关的疾病或者特殊性状的数据库,通过分析环状RNA与那些疾病相关的miRNA的相互作用,从而在环状RNA和疾病之间建立起关联。同时为了进一步分析环状RNA在疾病中的调控路径,还构建了circRNA的ceRNA调控网络。该数据库的网址如下

http://gyanxet-beta.com/circdb/

数据库的构建需要依赖以下4种信息,对应的来源描述如下

  1. 从miR2disease数据库得到疾病相关的miRNA信息

  2. 从Memzcak等人的研究中得到环状RNA与miRNA的相互作用关系

  3. 从starBase数据库得到miRNA-mRNA的相互作用信息

  4. 从miRCode数据库得到miRNA和lncRNA的相互作用信息

目前官网只提供了数据下载的功能,示意如下

circ2Traits数据库有什么用

第一个文件是ceRNA调控网络信息,内容示意如下,第一类为miRNA,第二列为protein coding或者lncRNA转录本,第三列为环状RNA,第四列为疾病的名称

circ2Traits数据库有什么用

第二个文件是环状RNA的所有信息,包含了circRNA-miRNA和circRNA和miRNA结合区域的SNP信息,内容列数很多,截取如下

circ2Traits数据库有什么用

通过该数据库,可以得到疾病相关的环状RNA信息,同时其分析疾病相关的环状RNA的思路和将circRNA,ceRNA,SNP信息整合的策略都值得借鉴。

以上是“circ2Traits数据库有什么用”这篇文章的所有内容,感谢各位的阅读!相信大家都有了一定的了解,希望分享的内容对大家有所帮助,如果还想学习更多知识,欢迎关注创新互联行业资讯频道!


当前文章:circ2Traits数据库有什么用
文章起源:http://kswsj.cn/article/pcogcg.html

其他资讯