plantcircbase数据库有什么用-成都创新互联网站建设

关于创新互联

多方位宣传企业产品与服务 突出企业形象

公司简介 公司的服务 荣誉资质 新闻动态 联系我们

plantcircbase数据库有什么用

这篇文章将为大家详细讲解有关plantcircbase数据库有什么用,小编觉得挺实用的,因此分享给大家做个参考,希望大家阅读完这篇文章后可以有所收获。

创新互联公司是一家专注于成都做网站、成都网站建设与策划设计,镇宁网站建设哪家好?创新互联公司做网站,专注于网站建设10余年,网设计领域的专业建站公司;建站业务涵盖:镇宁等地区。镇宁做网站价格咨询:13518219792

plantcircBase是一个植物环状RNA的数据库,网址如下

http://ibi.zju.edu.cn/plantcircbase/index.php

该数据库包含了以下13个物种的环状RNA信息

  1. Arabidopsis thaliana

  2. Gossypium arboretum

  3. Gossypium hirsutum

  4. Glycine max

  5. Gossypium raimondii

  6. Hordeum vulgare

  7. Oryza sativa

  8. Poncirus trifoliata

  9. Solanum lycopersicum

  10. Solanum tuberosum

  11. Triticum aestivum

  12. Tea tree

  13. Zea mays

收录了来自这13个物种共98317个环状RNA,利用物种对应的RNA_seq数据,采用了多款生物信息学软件进行预测,以拟南芥为例,每款软件预测的环状RNA数量如下

plantcircbase数据库有什么用

通过导航栏的Browse菜单,可以浏览不同物种环状RNA的记录,示意如下

plantcircbase数据库有什么用

拟南芥共收录了4916个环状RNA,结果示意如下

plantcircbase数据库有什么用

点击环状RNA的name,可以查看详细信息,示意如下

plantcircbase数据库有什么用

通过导航栏的Visualize菜单,可以通过可视化的方式查看环状RNA的结构,示意如下

plantcircbase数据库有什么用

除了染色体位置,来源基因,序列等基本信息外,该数据库还提供了circRNA-miRNA-mRNA的ceRNA调控网络信息,通过菜单栏的Network菜单,可以查看特定环状RNA的调控网络,结果示意如下

plantcircbase数据库有什么用

关于“plantcircbase数据库有什么用”这篇文章就分享到这里了,希望以上内容可以对大家有一定的帮助,使各位可以学到更多知识,如果觉得文章不错,请把它分享出去让更多的人看到。


当前名称:plantcircbase数据库有什么用
网址分享:http://kswsj.cn/article/pgjjcd.html

其他资讯